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大正9年
内務省下関土木出張所長崎港修築事務所を設置(出島岸壁に着工)
昭和16年
内務省下関土木出張所相浦港修築事務所を設置
昭和20年
運輸省第四港湾建設部長崎港工事事務所を設置
昭和26年
長崎港重要港湾に指定
昭和26年
佐世保港重要港湾に指定
昭和26年
厳原港重要港湾に指定
昭和26年
福江港重要港湾に指定
昭和27年
運輸省第四港湾建設局長崎港工事事務所と改称
昭和28年
運輸省第四港湾建設局佐世保港工事事務所を設置
昭和34年
郷ノ浦港重要港湾に指定
昭和48年
運輸省第四港湾建設局佐世保港工事事務所を廃止し長崎港工事事務所に統合(佐世保事務所を設置)
昭和48年
長崎空港出張所を設置
昭和49年
蟐蛾瀬戸航路開発保全航路に指定
昭和49年
万関瀬戸航路開発保全航路に指定
昭和50年
長崎空港供用開始
昭和51年
壱岐事務所を設置
昭和61年
福江事務所を設置
昭和63年
対馬事務所を設置
平成2年
平戸瀬戸航路開発保全航路に指定
平成6年
万関瀬戸航路政令改正
平成9年
運輸省第四港湾建設局長崎港湾空港工事事務所と改称
平成13年1月6日
省庁再編成により国土交通省九州地方整備局長崎港湾空港工事事務所と改称
平成15年
長崎港湾・空港整備事務所と改称
平成16年3月
壱岐事務所を閉所
平成17年3月
佐世保事務所を閉所
平成17年4月
平戸事務所を設置
平成21年4月
郷ノ浦分室を設置
平成22年3月
厳原港出張所を閉所
平成23年3月
福江港分室を閉所
平成24年3月
郷ノ浦港分室を閉所
平成25年4月
厳原港分室を設置
平成26年3月
平戸事務所を閉所
平成30年4月
佐世保港整備推進室を設置